Animation of the Protein Ligand Docking

Animation of the Protein Ligand Docking
Vòng tròn màu đỏ đại diện cho Khoang gắn kết của Protein thụ thể (Receptor Binding Pocket Volume).
Cụ thể, vai trò và ý nghĩa khoa học của chúng bao gồm:
Xác định không gian đích: Các vòng tròn đỏ (được vẽ trên nhiều mặt phẳng khác nhau như xy, yz, xz và đường chéo) đóng vai trò như một lưới tọa độ 3D, định vị vùng không gian hoạt tính của protein mục tiêu (Target Receptor).
Mô phỏng trường lực hóa lý: Vòng đỏ thể hiện phạm vi giới hạn của lực hút tĩnh điện, lực Van der Waals hoặc liên kết hydro mà phân tử protein có thể tác động để "kéo" các phân tử thuốc về phía nó.
Đánh giá độ chính xác (Docking): Khi phân tử thuốc nhỏ (Ligand - các vòng màu xanh) di chuyển hoàn toàn vào bên trong vùng giới hạn của các vòng tròn đỏ này và các đường liên kết chuyển sang màu xanh lục (#00FF66), điều đó chứng tỏ quá trình gắn kết đã thành công, năng lượng tự do đạt mức tối thiểu và cấu trúc đạt trạng thái ổn định để ức chế bệnh.

Видео Animation of the Protein Ligand Docking канала Phuc Do