Гаплогруппы Y-хромосомы человека. Происхождение современных неафриканских линий Y-ДНК

Среди учёных сложилось общее мнение, что геномы человеческих популяций за пределами Африки почти полностью произошли в результате единственной крупной миграции около 50-70 тыс. лет назад. Эта миграция сопровождалась скрещиванием с неандертальцами или эти контакты были вскоре после неё, что привело к появлению около 2% неандертальской #ДНК в геномах всех неафриканцев. По длине этих неандертальских сегментов, было определено, что событие смешения произошло около 52-58 тыс. лет назад, а значит миграция из Африки должна была произойти до этого периода. В итоге уже смешанная с неандертальцами популяция быстро распространилась по Евразии и Австралии. Однако детали этого процесса остаются плохо изученными.
Были ли маршруты миграций прибрежными или внутренними? А может и теми, и другими?
Где и когда начали разделяться предки современных популяций?
А также в какой степени современные популяции сохраняют генетические следы этих древних людей?
Исследования древней ДНК с использованием образцов возрастом 50-70 тыс. лет потенциально могли бы дать ответы на эти вопросы, однако где же их взять в достаточном количестве и качестве.
Предыдущие генетические анализы указали на эффект основателя, когда огромные территории были заселены изначально малым количеством представителей человека разумного из одного источника, при этом генетическое разнообразие снижается по мере удаления от Африки по основным маршрутам расселения.
Результаты более ранних работ, также указывают на большое количество маленьких узких мест, своеобразных бутылочных горлышек.
При этом снижение генетического разнообразия вдоль маршрутов миграции довольно плавное и не дает доказательств серьезных генетических разрывов, которые можно было бы интерпретировать как доказательство существования человеческих «рас». Однако за 50 тысяч лет в процессе перемещения популяций и их неоднократного смешения, ситуация стала значительно отличаться от древней, что отражено в геномах древних и современных людей.
Таким образом, понимание того, как складывался генофонд популяций после первоначального выхода из Африки затруднено из-за сложности последующих событий и нехватки древней ДНК, что требует более сложных методов для ответа на поставленные вопросы. Один из таких методов основан на Y-хромосоме человека.
Благодаря гаплотипам или совокупности аллелей на локусах одной хромосомы можно создать подробное калиброванное филогенетическое дерево. Несколько таких деревьев были построены независимо друг от друга, и все они указывают на массовое распространение неафриканских линий около 50-60 тыс. лет назад, начиная с одной гаплогруппы, обозначенной как CT. Принимая во внимание редкую африканскую линию D0 и временные рамки, авторы ранее утверждали, что первоначальные расколы внутри линии CT, вероятно, произошли в ещё Африке до выхода, а три линии C, D и F, были переданы предками современных неафриканцев. Каждая из этих трех линий впоследствии также разделилась: C и D умеренно, а F на значительно большее количество линий. В данной работе учёные решили более детально взглянуть на ранние деления внутри этих трех линий.
#наука #генетика #история #гаплогруппы
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
Поддержать канал:

https://www.patreon.com/user/overview?u=12102350

https://www.donationalerts.com/r/baboon_scientist
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
Источники:
Hallast, P., Agdzhoyan, A., Balanovsky, O. et al. A Southeast Asian origin for present-day non-African human Y chromosomes. Hum Genet 140, 299–307 (2021). doi.org/10.1007/s00439-020-02204-9
Вспомогательные материалы:
Geography predicts neutral genetic diversity of human populations
Franck Prugnolle, Andrea Manica, François Balloux doi.org/10.1016/j.cub.2005.02.038
Marc Haber, Abigail L Jones, Bruce A Connell, Asan, Elena Arciero, Huanming Yang, Mark G Thomas, Yali Xue, Chris Tyler-Smith, A Rare Deep-Rooting D0 African Y-Chromosomal Haplogroup and Its Implications for the Expansion of Modern Humans Out of Africa, Genetics, doi.org/10.1534/genetics.119.302368
On the origin of modern humans: Asian perspectives
Christopher J. Bae, Katerina Douka, Michael D. Petraglia,
DOI: 10.1126/science.aai9067
By Lavanya Rishishwar and I. King Jordan - Rishishwar L, Jordan IK. Implications of human evolution and admixture for mitochondrial replacement therapy. BMC Genomics. 2017;18:140. doi:10.1186/s12864-017-3539-3.
Фото и видео:
File-Y-Chromosom_und_Wanderwege_des_Menschen.webm
File-Y-Chromosom_und_der_Stammbaum_des_Menschen.webm
ZDF/Terra X/Tobias Schultes/Albrecht M. Wendlandt
By User:Maulucioni - Migraciones humanas en haplogrupos mitocondriales.PNG, commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=32585433

Видео Гаплогруппы Y-хромосомы человека. Происхождение современных неафриканских линий Y-ДНК канала Археология, история, генетика — исследования